Une pompe hygiénique est utilisée dans les systèmes où la propreté est essentielle pour le produit pompé, comme les produits alimentaires, les boissons et les produits pharmaceutiques. Les pompes hygiéniques doivent pouvoir être nettoyées et désinfectées régulièrement et doivent traiter les liquides en douceur. Parmi les critères permettant de considérer qu'une pompe est hygiénique, on peut citer la certification ATEX ainsi que d'autres certifications.